Den großen Unterschied, den ich sehe, ist (abgesehen des Gonzo Übertreibens von 40Kilo) die Tatsache, dass bei WH40K Staat (Inquisition und Militär) und Kirche nicht nur an einem Strang ziehen, sondern sich gegenseitig auch noch antreiben, und die Legitimation besitzen alles andere (Adelshäuser, Gilden, ...) auszulöschen, wenn die nicht mitziehen, während Fading Suns so ein schönes Gleichgewicht widerstrebender Kräfte besitzt.
Die Fraktionen von FS sind auch nicht nett, sondern selfisch, aber es gibt immer jemanden, der sie im Zaum hält.
Und es gibt eben nicht so extreme Auswüchse (selbst Symbionten, Vuldrok, Kurgan und das Dunkle zwischen den Sternen sind noch irgendwo "greifbar"), während dessen WH40K ein einziger extremes Auswuchs ist.
Fading Suns befindet sich in unsicherem Gleichgewicht(en) während WH40K sich in ewig währenden Konflikt befindet.
Das ist so ein krasser Unterschied, wie der, der zwischen "gemeinsam gemütlich einen Single-Malt Abend genießen" und "beim Flat-Rate-Party saufen nach dem Kotzen weitersaufen" besteht. (nur meine Meinung - muss man nicht teilen...)