Du könntest eine clock geben, die buchstäblich "Plot Armor" heißt, und die erst nach wichtigen Storyerfolgen, oder nach Eroberung eines bestimmten Gebiets, aufgefüllt wird
ok, ziemlich meta. Aber ich fänd es ok.
Ansonsten gibt es ja auch die Möglichkeit, dass sie einfach auch bei vollem Erfolg noch böse austeilen, bevor man nicht einfach konkrete Gegenmaßnahme erforscht hat. Generell würde ich halt versuchen, es über Fiktion zu begründen.
Und hey, wenn das ein Hänfling ist, der schutzlos mit einer Gang herumsteht, dann mach den nicht wichtig