Also ich weiß nicht, ob da überhaupt ein Problem ist, an sich hast du das ja gut verstanden. Du wählst deine Armee aus einem Kontingent pro 2000 Punkte. Ein Kontingent besteht aus einem Armeeorgplan der Hauptarmee (Pflicht; 1 HQ, 2 Std; Optional: 1 HQ, 3 Elite, 4 Std, 3 Sturm, 3 Unterstützung), einer Befestigung (optional) und einem optionalen Verbündetenkontingent (afaik: Pflicht; 1 HQ, 1 Std, Optional 2 elite, 2 Sturm, 3 Std, 2 Unterstützung ... aber steht ja im Regelbuch)
Du kannst also Eldar als Hauptkontingent nehmen und Dark Eldar als Verbündetenkontingent. Beide Armeen zählen als Waffenbrüder was der stärkste Grad unter Alliierten ist. Keiner kann also den anderen beschießen, Eldar können Psi auf Dark Eldar anwenden und Unabhängige Charaktermodelle können isch afaik den anderen Einheiten anschließen.
Aber Transporter werden z.B. nicht geteilt (verstehe ich ebensowenig wie du, aber wahrscheinlich wollten sie verhindern, dass schwere Terminatoren mit Schattenbarken übers Feld fliegen).
Die Sonderregel der Dark Eldar "Macht durch Schmerz" greift nur für Modelle, die mit dieser Sonderregel ausgestattet sind. Eldar können also keine Schmerzmarker generieren und profitieren nicht von den Vorteilen. Man kann auch keinen Schmerz teilen, wenn ein Charaktermodell der Dark Eldar sich einer Eldar Einheit anschließt.
