Zu den Regeln kann ich nicht viel sagen, da ich den FATE HAck nicht kenne und mit FATE generell (noch) nicht so vertraut bin.
Die Settings sind sich in vielen Bereichen recht ähnlich, es gibt allerdings schon Unterschiede:
Wo EP vom Hintergrund her ziemlich festgelegt und definiert ist, ist NP offener und freier. Es ist nicht ganz ein Sandkastensetting, geht aber in die Richtung.
NP gibt dir viele Anregungen an die Hand was du mit dem Hintergrund tun kannst, vor allem die Handelshäuser/Magakonzerne die sich einen Schattenkrieg liefern bieten da viele Möglichkeiten.
Also kurz: Wenn du einen sehr definierten und etablierten Hintergrund möchtest, greif zu EP. Wenn du eher eigene Ideen einbringen willst und einen Background suchst der mehr Platz läßt, aber trotzdem genug Anregungen bietet, nimm NP.
Mir gefällt beides und beides hat seine Berechtigung.