Hier gibts ein paar Tipps die ich so direkt unterschreiben würde, ansonsten vielleicht noch:
- Backup-NPCs: manchmal kann es passieren dass NPCs, die in späteren Kapiteln noch wichtig werden sollten, frühzeitig ausscheiden - durch Würfelpech (wobei da oft "Plot Armor" benutzt wird), clevere Spieler, oder weil man als SL was wichtiges übersehen hat. Wie groß dieses Problem ist hängt natürlich vom AP ab, aber wenn man beim Lesen den Eindruck hat eine potentielle Lebensgefahr für einen wichtigen NPC gefunden zu haben, sollte man schauen ob man mit einem Backup, bzw. Funktions/Rollen-Übernahme durch einen anderen NPC eine Reißleine für den Fall der Fälle vorbereiten kann (es kann durchaus passieren dass sich einer der PCs dafür anbietet!).
- als Ergänzung zu Punkt 8 des o.g. Links: wenn man beim Vorbereiten das Gefühl hat, dass die geplante Story/Szene nicht wirklich toll ist, sind die Chancen gut dass das auch wirklich so ist. Alle APs haben Stärken und Schwächen. Man findet, besonders im Paizo-Forum, online aber sehr häufig Ideen wie schwache Konstruktionen am besten gerettet oder geändert werden können.
- erlaubte Materialien/Quellen: gerade wenn man kein gewiefter Systemtheoretiker ist kann es dankbar sein, nicht alles zu erlauben wo Paizo oder ein Labelname des eigenen Vertrauens draufsteht. Genau wie bei D&D 3rd Edition gilt für Pathfinder, dass jedes Zusatzbuch das Potential hat, das Powerlevel der SCs stark anzuheben (auch ungewollt), und damit über den von den APs angepeilten "Standard" hinauszuschießen. Das geht natürlich auch mit den Core Rules, nur sind die Optionen da doch recht überschaubar während die Zusatzbände oft sehr versteckte, nicht offensichtliche Probleme machen können. Wie streng man das alles sieht hängt natürlich von der eigenen Runde und dem eigenen Geschmack ab, aber wenn man bei Zweifeln die erlaubten Materialien auf CRB, APG, den Player's Guide zum AP sowie vielleicht ein-zwei thematisch passende Companions beschränkt, macht man nichts falsch.
- Namensliste: es hilft enorm wenn man nicht nur die wichtigen Namen des aktuellen Kapitels irgendwo griffbereit hat (mit kruzer Erläuterung wer zum Geier das ist), sondern auch eine Blanko-Liste von passenden Namen für den Fall dass ein ungeplanter/random NPC plötzlich Gesprächsthema wird. Den Witz, dass jeder Schankwirt Bob heißt, kennt jeder - eben weil er nicht lustig ist